Hi-seq 和Mi-Seq是Illumina公司推出的新一代的測序儀，采用穩定的可逆終止法邊合成邊測序技術，能夠為傳統基因組學研究（測序和注釋）以及功能基因組學 （基因表達及調控，基因功能，蛋白/核酸相互作用）研究等提供迅捷、龐大、準確測序服務。具有高準確性，高通量，高靈敏性和低運行成本等突出優勢。
Hi-Seq 2500高通量測序平臺，擁有高通量運行和快速運行兩種模式，提供多種讀長選擇，也可使用一個或兩個流動槽，使之成為一個靈活且可擴展的平臺。高產量模式單次運行可以產出600Gb數據，適合樣品量較多，或需要最深度覆蓋的應用。快速運行模式最多能在一天之內產生100Gb左右的數據，提供2×150 bp的測序讀長，有助于改善de novo應用的組裝效果。
Mi-Seq測序儀是目前唯一一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數據分析的新一代測序儀，每次運行能產生超過7Gb的數據，測序讀長2×250 bp，Mi-Seq有著革命性的流程和無可比擬的準確性，是快速且經濟高效的遺傳分析的理想平臺，應用廣泛。
Illumina測序平臺廣泛應用于特定的生物基因組或環境宏基因組高通量測序服務，包括：動植物、微生物基因組從頭測序、基因組重測序；基因組轉錄組測序、表達譜測序、小RNA測序；環境樣品宏基因組從頭測序、微生物多樣性檢測等。例如：Illumina測序技術完成人類腸道微生物宏基因組測序刊登于Nature；DNA捕獲和測序技術鑒定全基因組人類RNA編碼位點刊登于Science。
Illumina GA、Roche/454和Sanger對人類腸道微生物檢測范圍比較和炎癥性腸病患者與健康人群腸道內細菌豐度差別
江蘇中宜金大分析檢測有限公司現有Hi-seq 2500一臺，Mi-Seq一臺，曙光服務器一臺，可提供動植物、微生物基因組測序，基因組轉錄組、表達譜測序，環境樣品宏基因組等測序服務。已開展宏基因組測序在氯化消毒飲用水中微生物抗生素耐藥性，制革污水處理廠活性污泥鎘和銅抗性基因等方面研究。
過濾水、消毒水和自來水中抗生素抗性基因的類型和相對豐度
參考文獻：
[1] Junjie Qin, Ruiqiang Li, Jeroen Raes, et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature, 2010, 464, 59-65.
[2] Jin Billy Li, Erez Y. Levanon, Jung-Ki Yoon, et al. Genome-Wide Identification of Human RNA Editing Sites by Parallel DNA Capturing and Sequencing. Science, 2009, 324, 1210-1213.
[3] Shi Peng, Jia Suyu, Zhang Xuxiang, Zhang Tong, Cheng Shupei, et al. Metagenomic insights into chlorination effects on microbial antibiotic resistance in drinking water. Water Res, 2013, 47, 111-120.
[4] Jia Suyu, Wang Zhu, Zhang XuXiang, Liu Bo, et al. Metagenomic analysis of cadmium and copper resistance genes in activated sludge of a tannery wastewater treatment plant. Journal of Environmental Biology, 2013, 34, 375-380.
